San Juan del Puerto, Florida, Historiskt område för en spansk mission i Jacksonville, USA.

San Juan del Puerto var en spansk franciskanermission på Fort George Island nära mynningen av St. Johns River, i dagens Jacksonville. Den grundades före 1587 för att betjäna saturiwa, ett timucuafolk, och organiserades genom att de delades in i nio mindre byar. Den blev en av de tre huvudmissionerna i Mocama-provinsen, tillsammans med San Pedro de Mocama på Cumberland Island och Santa Maria de Sena på Amelia Island.

Bosättningen grundades omkring 1587 som en spansk utpost för kolonisering och för att omvända Timucua-folket till kristendomen. Den övergavs 1702 när samhället skingrades.

Namnet San Juan del Puerto gavs av spanjorerna, och Saturiwa delades in i nio mindre byar kring missionen. Efter 1650 bosattes Guale-flyktingar från Georgias kust här vid sidan av Mocama. Fader Francisco Pareja lärde en del Mocama det skriftsystem han utarbetat för timucua.

Missionsplatsen ligger på Fort George Island nära mynningen av St. Johns River, i dagens Jacksonville; ön nås med bil från fastlandet. Källorna nämner varken markerade stigar, utgrävningar eller besöksanläggningar, så räkna med öns terräng och inte med en ordnad arkeologisk park.

1612 tryckte Francisco Pareja, som verkade vid denna mission, en katekes på spanska och timucua. Den anses vara den första boken tryckt på ett ursprungsfolkets språk i Amerika. Missionen var en av tre huvudmissioner i Mocama-provinsen, tillsammans med San Pedro de Mocama på Cumberland Island och Santa Maria de Sena på Amelia Island.